В структуре ГНЦ колопроктологии функционируют поликлиника и ряд специализированных отделений: гастроэнтерология, онкопроктология, оперблок и др. Обследование пациентов проводится посредством эндоскопии, лучевой диагностики, микробиологических исследований и с использованием ресурсов клинико-химической лаборатории.
К услугам посетителей центра доктора, специализирующиеся на общей и реконструктивной проктологии, эксперты в области неотложной помощи, анестезии и реанимации. Помимо этого в штате сотрудников имеются врачи, предоставляющие грамотные и развернутые консультации по вопросам колопроктологических заболеваний.
К отличительным преимуществам научно-клинического медицинского учреждения можно отнести следующее:
- первое в СССР и единственное в Российской Федерации научно-клиническое учреждение, целиком специализирующееся на заболеваниях ободочной и прямой кишок, заднего прохода, органов таза и промежности;
- полный спектр методов диагностики и лечения этих заболеваний;
- 98 специалистов, сертифицированных в колопроктологии, онкологии, функциональной и лучевой диагностике, 9 профессоров, 12 докторов и 50 кандидатов медицинских наук.
Являясь головным учреждением Российской Федерации, ГНЦ колопроктологии интегрирован в международный научный процесс: сотрудники института состоят в редакционных коллегиях ведущих международных изданий, широко представлены в научных комитетах таких международных сообществ как Европейский Совет по колопроктологии, Всемирная Ассоциация университетских колоректальных хирургов.